Pokémon XD: Gale of Darkness เป็นเกมเล่นตามบทบาทที่รวบรวมสิ่งมีชีวิตล่าสุดในซีรีส์ สล็อต และมีเพียงเกมโปเกมอนตัวจริงเกมที่สองเท่านั้นที่จะปรากฏบน GameCube ค่อนข้างน่าแปลกใจเพราะซีรีส์นี้ไม่ได้เปลี่ยนแปลงอะไรมากจากตอนหนึ่งไปเป็นตอนต่อไป Gale of Darkness ยังคงรักษาสูตรการต่อสู้กับสัตว์ประหลาดพื้นฐานไว้เหมือนรุ่นก่อน แต่ด้วยเกมที่เล่นคนเดียวที่ยาวกว่าและการปรับแต่งการเล่นเกมเล็กน้อยเพื่อจัดการกับข้อร้องเรียนทั่วไปเกี่ยวกับเกมก่อนหน้านี้ ผลลัพธ์ก็คือ มีเพียงคนเดียวที่ชื่นชมเกมนี้จริงๆ คือผู้ที่คุ้นเคยกับซีรีส์นี้อยู่แล้ว Gale of Darkness เกิดขึ้นห้าปีหลังจากเหตุการณ์ใน Pokémon Colosseum เรื่องราวเริ่มต้นด้วยโปเกมอนเงาขนาดมหึมาโจมตีเรือบรรทุกสินค้ากลางมหาสมุทร ปรากฎว่าเรือบรรทุกสินค้านั้นเต็มไปด้วยโปเกมอนเงาที่ทรงพลัง แต่อันตราย หากคุณเล่นโคลอสเซียม คุณจะจำได้ว่าโปเกมอนเงานั้นเหมือนกับโปเกมอนทั่วไปทุกประการ ยกเว้นว่าโปเกมอนเหล่านั้น “ปิดประตูหัวใจ” และก้าวร้าวต่อมนุษย์ กลุ่มที่จัดการปล้นเรือนั้นรู้จักกันในชื่อ Cipher และเมื่อคุณเรียนรู้เพิ่มเติมเกี่ยวกับพวกเขา คุณจะพบว่าโดยพื้นฐานแล้วพวกเขาต้องการรวบรวมโปเกมอนเงาทั้งหมดเพื่อสร้างกองทัพของสิ่งมีชีวิตที่ชั่วร้ายที่จะยึดครองโลก คุณเล่นเป็นเด็กหนุ่มที่บังเอิญเป็นผู้ฝึกสอนโปเกมอนที่มีพรสวรรค์ ดังนั้นมันขึ้นอยู่กับคุณที่จะขัดขวางแผนการของ Cipher และชำระล้างโปเกมอนเงาทั้งหมด

คุณจะเริ่มเกมด้วยโปเกมอนตัวเดียว Evee และคุณจะได้เข้าร่วมการต่อสู้กับสิ่งมีชีวิตกับผู้คนบนท้องถนน ในโคลอสเซียม และในที่ซ่อนของศัตรูและพื้นที่อื่น ๆ ของการโต้แย้ง ในช่วงต้น คุณจะได้รับอุปกรณ์ที่ให้คุณเห็นเงาโปเกมอน (ราวกับว่าการโจมตีด้วยเงาของพวกมันไม่ได้ทำให้หายไป) ด้วยการใช้อุปกรณ์นั้น คุณยังสามารถขโมยโปเกมอนเงาเหล่านั้นจากเทรนเนอร์ที่คุณกำลังต่อสู้อยู่ได้ หลังจากจับโปเกมอนเงาได้ คุณจะต้องชำระมันให้บริสุทธิ์เพื่อที่มันจะเปิดใจให้คุณและเป็นเพื่อนที่ซื่อสัตย์ของคุณ คุณยังสามารถทำให้โปเกมอนเงาบริสุทธิ์ได้โดยเก็บไว้ในปาร์ตี้ของคุณและใช้ในการต่อสู้ แต่ Gale of Darkness ยังแนะนำห้องชำระล้างใหม่ที่ทำให้กระบวนการทำให้บริสุทธิ์ทั้งหมดง่ายขึ้นมาก